Su presencia en un producto puede ser causa de problemas de salud en las personas que lo consuman. Existen otros microorganismos no considerados patógenos ya que no inciden en la salud del usuario, pero que producen un deterioro importante en las características del producto. La transcendencia de sus efectos hace de ellos objetos de su investigación.

Los reglamentos establecidos para detectar y minimizar el riesgo ocasionado por estos microorganismos patógenos:

• Reglamento (CE) 178/2002, por el que se establecen los principios y los requisitos generales de la legislación alimentaria.
• Reglamento (CE) 2073/2005, relativo a los criterios microbiológicos aplicables a los productos alimenticios.
• Reglamento (CE) 1223/2009 sobre los productos cosméticos, permite garantizar un alto nivel de seguridad a los consumidores.

Los microorganismos más investigados son:

Laboratorios LIMSA realiza análisis para la detección de microorganismos con métodos de referencia ISO, European Pharmacopoeia, etc. o métodos alternativos rápidos validados según la norma ISO 16140, AFNOR, AOAC, etc.